Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ROPN1BQ9BZX4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ROPN1BQ9BZX4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms