Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM8Q9BZR9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms