Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTRT3Q9BYD9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACTRT3Q9BYD9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms