Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CARD11Q9BXL7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CARD11Q9BXL7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARD11Q9BXL7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms