Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms