Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SF3B5Q9BWJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SF3B5Q9BWJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms