Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF4Q9BUZ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF4Q9BUZ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms