Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM175Q9BSA9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM175Q9BSA9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms