Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAAF1Q9BRP4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms