Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF8Q9BRL6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF8Q9BRL6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms