Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SDF4Q9BRK5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SDF4Q9BRK5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms