Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MESP1Q9BRJ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms