Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZSWIM1Q9BR11 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZSWIM1Q9BR11 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZSWIM1Q9BR11 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms