Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCAPGQ9BPX3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCAPGQ9BPX3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms