Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GAL3ST1Q99999 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GAL3ST1Q99999 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms