Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LYSTQ99698 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms