Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPS8Q99627 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS8Q99627 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms