Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORT1Q99523 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SORT1Q99523 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms