Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN18Q96SJ8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms