Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS6KC1Q96S38 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms