Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC37.08■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
IFT140Q96RY7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms