Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTAGE1Q96RT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE1Q96RT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms