Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UIMC1Q96RL1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UIMC1Q96RL1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UIMC1Q96RL1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms