Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PHF12Q96QT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHF12Q96QT6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms