Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC4A9Q96Q91 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms