Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAPPC9Q96Q05 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms