Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP4Q96PP9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GBP4Q96PP9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms