Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C8orf49Q96NF6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C8orf49Q96NF6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms