Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ROBO3Q96MS0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ROBO3Q96MS0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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