Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGBL1Q96MI9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGBL1Q96MI9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms