Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC114Q96M63 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC114Q96M63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC114Q96M63 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms