Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00479Q96M42 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00479Q96M42 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms