Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNPC3Q96LT9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNPC3Q96LT9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNPC3Q96LT9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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