Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX27Q96L92 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms