Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD3Q96L08 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SUSD3Q96L08 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms