Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms