Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CABS1Q96KC9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABS1Q96KC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms