Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM46AQ96IP4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM46AQ96IP4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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