Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF185Q96GF1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF185Q96GF1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms