Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EDC3Q96F86 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms