Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC97Q96F63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC97Q96F63 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms