Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RNFT2Q96EX2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RNFT2Q96EX2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms