Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHFRQ96EP1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHFRQ96EP1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms