Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL39LQ96EH5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39LQ96EH5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms