Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C18orf8Q96DM3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C18orf8Q96DM3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms