Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC74AQ96AQ1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC74AQ96AQ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms