Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLUAP1Q96AJ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLUAP1Q96AJ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms