Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC17Q96AE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms