Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RFT1Q96AA3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms