Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC102AQ96A19 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC102AQ96A19 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC102AQ96A19 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms